Податковий кодекс передбачає скасування спецрежиму ПДВ для сільгосппідприємств з 01.01.2017. У зв'язку з цим, спецрежимникам Державне казначейство України повинно закрити рахунки в СЕА ПДВ з дня, наступного за граничним терміном сплати податкових зобов'язань за грудень 2016 року (за IV квартал 2016 року для платників, у яких квартальний податковий період).

Листом ДФС України від 03.01.2017 №8/7/99-99-15-03-02-17 визначила окремі особливості завершення спеціального режиму для сільськогосподарських підприємств та їх перехід на загальну систему оподаткування ПДВ.

Реєстрація податкових накладних та/або розрахунків коригування до податкових накладних у ЄРПН, складених сільськогосподарськими підприємствами, що застосовували спецрежимниками, за операціями з постачання сільськогосподарських товарів/послуг, повинна бути здійснена не пізніше 15 січня 2017 року.

Сума від'ємного значення за операціями поставки сільськогосподарських товарів/послуг, сформована сільськогосподарськими підприємствами, які застосовували спеціальний режим оподаткування ПДВ, за результатами звітного (податкового) періоду за грудень 2016 роки (IV квартал 2016 року), переноситься в податкову звітність наступного звітного (податкового) періоду, в якій відображаються розрахунки з бюджетом.

Інші зміни з ПДВ:

процедура відшкодування ПДВ зазнала змін. Буде запущений єдиний реєстр платників, які заявили про відшкодування ПДВ. Повернення узгоджених сум бюджетного відшкодування здійснюється у хронологічному порядку відповідно до черговості внесення до Реєстру заяв про повернення суми бюджетного відшкодування. Дані реєстру будуть перебувати у відкритому доступі;

сума повернення переплат з бюджету на електронний рахунок в СЕА збільшує суму ліміту, в тому числі по поверненнях 2016 року;

реєстрація податкових накладних можлива протягом 365 днів з дня її складання. При цьому змінений штраф за порушення строків реєстрації від 61 до 365 днів – 40 % від суми ПДВ, штраф за не зареєстровані податкові накладні (понад 365 днів) – 50 % від суми ПДВ;

при реорганізації платника сума залишкового від'ємного значення підлягає перенесенню до складу ПК правонаступника(-ів). Аналогічно зі складовими суми ліміту в СЕА;

з 01.07.2017 реєстрація ПН  розрахунків коригувань може бути зупинена по сукупності критеріїв оцінки ступеня ризиків, достатніх для зупинення реєстрації, які будуть визначені Кабміном. При цьому, термін реєстрації ПН та роз. коригування продовжується в разі припинення їх реєстрації в ЄРПН;

в той же час з 01.07.2017 платник-покупець отримає право на податковий кредит з моменту реєстрації ПДВ-накладної, незалежно від того чи був використаний такий товар/послуга в оподатковуваної господарської діяльності в цьому податковому періоді чи ні;

установлення мораторію на застосування штрафних санкцій та пені до сільгосппідприємств, що застосовували спецрежим обкладення ПДВ відповідно до ст. 209 ПКУ, за заниження такими платниками податкового зобов’язання з ПДВ або завищення ними бюджетного відшкодування, які виникли внаслідок порушення порядку розподілу податкового кредиту, визначеного пп. 209.15.1 ПКУ, за звітні (податкові) періоди з 01.01.2016 р. по 01.01.2017 р. (уведено п. 54 р. ХХ ПКУ);

застосування нульової ставки ПДВ на операції магазинів безмитної торгівлі з продажу ними товарів фізичними особами, які в’їжджають на митну територію України в пунктах пропуску через державний кордон України, відкритих для міжнародного повітряного сполучення (зміни до пп. «ґ» пп. 195.1.2 ПКУ);

скасовано звільнення від обкладення ПДВ операцій із увезення на митну територію України ПАТ «Нафтогаз України» природного газу (виключено п. 197.22 ПКУ);

подовжено до 01.01.2019 р. звільнення від обкладення ПДВ операцій із постачання, у т.ч. операцій з імпорту, відходів та брухту чорних і кольорових металів, а також паперу та картону для утилізації (зміни до п. 23 р. ХХ ПКУ);

подовжено до 01.01.2019 р. касовий метод виникнення податкових зобов’язань і податкового кредиту платниками податку, які здійснюють постачання (у т.ч. оптове), передання, розподіл електричної та/або теплової енергії, постачання вугілля та/або продуктів його збагачення товарних позицій 2701, 2702, 2703 00 00 00, 2704 00 згідно з УКТ ЗЕД (зміни до п. 44 р. ХХ ПКУ);

подовжено до 01.01.2019 р. звільнення від обкладення ПДВ операції з постачання на митній території України вугілля та/або продуктів його збагачення товарних позицій 2701, 2702, 2703 00 00 00, 2704 00 згідно з УКТ ЗЕД й уточнено строк подання заяви щодо відмови від використання такої пільги, яка подаватиметься до настання звітного періоду, у якому платник податку не передбачає використання зазначеної пільги (зміни до п. 45 р. ХХ ПКУ);

подовжено до 01.01.2023 р. звільнення від обкладення ПДВ космічної діяльності (зміни до п. 3 р. ХХ ПКУ);

подовжено до 01.01.2019 р. звільнення від обкладення ПДВ кінематографічної діяльності (зміни до п. 12 р. ХХ ПКУ);

тимчасово, на період проведення АТО й/або запровадження воєнного стану відповідно до законодавства, звільнено від обкладення ПДВ операції з увезення на митну територію України та постачання на митній території України ниток і тканин (матеріалів) для виготовлення бронежилетів та шоломів (зміни до п. 32 р. ХХ ПКУ);

до 31.12.2017 р. установлення мораторію на застосування штрафних санкцій, передбачених п. 1201.3 ПКУ, за помилки, допущені в податковій накладній під час зазначення коду товару згідно з УКТ ЗЕД і/або коду послуги згідно з Державним класифікатором продукції та послуг (зміни до п. 351 р. ХХ ПКУ);

установлення розстрочення (рівними частинами) сплати ПДВ на строк до 36 календарних місяців, без нарахування процентів і пені на операції з увезення на митну територію України деревообробного обладнання й обладнання для виробництва медичних виробів (уведено п.п. 58, 59 р. ХХ ПКУ).